Що ми знаємо про штами коронавірусу: перелік і характеристики

Вже описані випадки повторного зараження, коли людина, яка одужала, хворіла знову, зустрівшись з іншою версією тієї ж інфекції. Ба більше, недуг в такому випадку може протікати навіть важче.

Цей висновок наведено у дослідженні вчених з лікарні Х'юстона Чиказького університету, Аргоннської національної лабораторії та Техаського університету в Остіні. Його було опубліковано ще у розпал пандемії – у вересні 2020 року.

А 4 січня 2022 року зафіксовано 12 інфікованих людей новим штамом коронавірусу, який отримав назву IHU. Про нього заявили на півдні Франції. 

Наразі очікується поява штаму IHUSNIM.

Тож, скільки варіантів коронавірусу вже відомо і чи буде кінець цьому переліку? 

Що таке коронавірус SARS-CoV-2

Кожен вірус має свій геном – унікальну специфічну послідовність ДНК або РНК.

Геном SARS-CoV-2 - це довга послідовність РНК. Порядок може змінюватися: при складанні кожної нової копії вірусу в будь-якій з цих ланок може статися помилка – заміна одного нуклеотиду іншим, – і в результаті трохи зміниться код всього ланцюжка.

У кожному новому "господарі" геном вірусу трохи змінюється. Ці зміни можуть бути зовсім незначними, але вони дозволяють встановити зв'язок між інфікованими або простежити шлях, який пройшов вірус.

Використовуючи слово "штам", вчені кажуть про генетично відмінну гілку вірусу, що відрізняється однією або декількома мутаціями від свого "батька". Різниця може становити лише частку відсотка від усього геному, але кожна нова послідовність РНК започаткувує нову гілку вірусу - тобто новому штаму.

Коронавірус SARS-CoV-2 спричиняє хворобу COVID-19 і має декілька примітних варіантів, які наразі є особливо важливими. 

Які штами коронавірусу відомі

Основних штамів нового коронавірусу вісім. Улітку 2021 року у Всесвітній організації охорони здоров'я вирішили позначати штами коронавірусу літерами грецького алфавіту, а не використати назви країн, де штами було виявлено. Все почалося зі штаму L – саме його виявили у китайському Ухані у грудні 2019 року. Однак тепер він поступово зникає.

Інші штами розподілені у світі неоднорідно: кожному континенті найбільш поширене, зазвичай, трохи більше двох основних варіацій. Їхнє поширення можна спостерігати на складеній вченими інтерактивній карті Nextstrain, на якій можна відстежити мутації вірусу.

Штам "Альфа" – B.1.1.7 ("кентський" або "британський" штам)

Вперше варіант коронавірусу виявили у Британії у жовтні 2020 року. Він розповсюдився вже на понад 50 країн.

Серед найпоширеніших симптомів британського штаму виділяють:

• кашель,
• сильна втома,
• біль у горлі та м'язах,
• втрата нюху та смаку зустрічається рідко

Крім того, штам «Альфа» порівняно з «китайським» варіантом швидше поширюється.

Штам "Бета" – B.1.351

Коронавіус вперше був виявлений у Південно-Африканській Республіці у травні 2020 року.

Серед усіх відомих штамів, варіант "Бета" вважають найменш заразним, втім він все одно поширюється швидше ніж звичайний коронавірус. Трансмісивність цього штаму оцінюється в середньому у 25%. Станом на 14 грудня 2021 року, цей варіант коронавірусу був виявлений у щонайменше 146 країнах.

Цей варіант коронавірусу є більш небезпечним для життя, ніж інші штами.

Штам "Гамма" – B.1.1.28 (P.1)

Варіант вперше був виявлений в Бразилії у листопаді 2020 року

Штам Гамма вважається більш заразним, ніж варіанти "Альфа" та "Бета". Трансмісивність цього штаму оцінюється в середньому у 38%, у порівнянні з оригінальним SARS-CoV-2. Станом на 14 грудня 2021 року, він поширений у 103 країнах.

Вирізняється серед інших штамів підвищеним ризиком повторного захворювання.

В середньому Гамма-штам призводить до смерті на 50% частіше, ніж звичайний коронавірус. 

Штамп "Дельта" – B.1.617.2

Варіант "Дельта" був вперше виявлений в жовтні 2020 року в Індії, тому його спочатку називали індійським штамом. Всесвітня організація охорони здоров'я (ВООЗ) класифікувала його як "тривожну мутацію", поряд з "Альфою", "Бетою" та "Гаммою".

Найпоширеніші симптоми COVID-19, викликані штамом – це головний біль, біль у горлі, нежить та лихоманка. Інфіковані люди можуть помилково прийняти симптоми за сильну застуду і не усвідомлювати, що їм потрібно самоізолюватися.

Про більш «традиційні» симптоми COVID-19, такі як кашель та втрата нюху, повідомляється набагато рідше. За даними лікарів Індії, пацієнти, інфіковані штамом Дельта, частіше страждають від втрати слуху, сильного болю в животі та нудоти.

Люди, у яких було підтверджено інфікування штамом "Дельта", також повідомили про інші симптоми, такі як:

• сухість у роті
• втрата апетиту
• болі в суглобах.

У більшості випадків пацієнти частіше госпіталізуються, потребують лікування киснем та страждають від розвитку ускладнень.

Всесвітня організація охорони здоров’я (ВООЗ) закликає повністю вакцинованих людей продовжувати носити захисні маски та дотримуватись інших заходів безпеки, пов’язаних з пандемією COVID-19. 

Різновид штаму "Дельта" – AY.4.2

У жовтні 2021-го у Росії виявили перші випадки зараження різновидом штаму "Дельта" – AY.4.2. 

Медики заявили, що новий варіант може бути на 10% заразнішим, але при цьому не викликатиме тяжчого захворювання, а вакцини проти нього залишаться ефективними.

За інформацією ВООЗ, "Дельта" остаточно витіснив решту штамів і став домінуючим у світі. Отримані мутації дали цьому варіанту переваги – він заразніший за попередників, а антитілам вакцинованих і перехворіли складніше його нейтралізувати. 

Еволюція коронавірусу, зокрема й самого штаму "Дельта", продовжується.

Наприкінці червня 2021 року з'явився "Дельта Plus", що відрізняється від "Дельти" мутацією S-білка K417N, яка була також у бета-варіанту коронавірусу (південноафриканського). Останній перебуває під наглядом медиків ВООЗ як варіант, що викликає занепокоєння.

У квітні у Великій Британії виявили ще один генетичний варіант коронавірусу AY.4.2, а до кінця вересня на нього припадало вже близько 6% зразків.

15 жовтня Департамент охорони здоров'я Британії включив AY.4.2 до списку моніторингу. AY.4.2 несе дві мутації в гені S-білка - Y145H та A222V. Поки не можна точно сказати, наскільки заразнішим і летальнішим є новий варіант, у цій галузі зараз проводяться дослідження. При цьому обидві мутації вже зустрічалися і раніше у різних лініях вірусу, але великого поширення ці лінії не набули.

Штам "Омікрон" з Південної Африки

Наприкінці листопада 2021 року з'являється новий штам коронавірусу, який сильно відрізняється від попередніх.

Лише за кілька тижнів графік щоденних заражень коронавірусу у ПАР встиг спочатку різко підскочити, спровокувавши чергове посилення обмежувальних заходів та перелякавши світові ринки, а потім так само різко та несподівано пішов на спад.

Попередні дані вчених про високу заразність "Омікрона" підтвердилися, як і інформація про те, що викликана цим варіантом інфекція здебільшого протікає легше, ніж у випадку з "Дельтою", і пацієнтам значно рідше потрібна професійна допомога медиків.

Всесвітня організація охорони здоров'я дізналася про новий варіант коронавірусу 24 листопада від влади Південної Африки, де на той час уже протягом двох з лишком тижнів спостерігалося впевнене зростання захворюваності на Covid-19.

Того ж дня ВООЗ взяла під посилене спостереження варіант B.1.1.529 (саме під такою назвою "Омікрон" був відомий до того, як отримав власне ім'я), а ще через два дні, 26 листопада, офіційно класифікувала його як побоювання.

Розшифровка геному вірусу допомогла встановити, що перші випадки захворювання, спричинені новим варіантом, було діагностовано у ПАР ще 9 листопада. Тобто приблизно тоді, коли в країні почалася нова, четверта за рахунком хвиля інфекції.

Було відомо лише те, що "Омікрон" значно відрізняється від попередніх варіантів: у його геномі вчені нарахували п'ять десятків мутацій, кожна з яких може вплинути на набір білків, що виробляються, а отже, і на властивості вірусу.

Тим часом кількість заражених "Омікроном" стрімко зростає, і в багатьох країнах він швидко став домінуючим варіантом. Тому даних для аналізу недоліку був.

Незабаром дослідження (проведені в основному на базі південноафриканських пацієнтів) підтвердили, що "Омікрон" поширюється з небаченою для "Дельти" швидкістю, подвоюючи кількість інфікованих кожні три-чотири дні - попри всі обмежувальні заходи.

Паралельно вченим із Гонконгу вдалося знайти й причину підвищеної заразності – чи, швидше, одну із причин. Виявилося, що у верхніх дихальних шляхах (саме туди вірус потрапляє спочатку) "Омікрон" розмножується в 70 разів швидше за "Дельту" - і, відповідно, набагато простіше заражає оточуючих.

Основних відмінностей три. По-перше, відомо, що найбільшу небезпеку вірус становить для людей похилого віку, а середній вік жителів ПАР – близько 27 років (для порівняння, в Європі – 44 роки).

Новий варіант B.1.640.2 – IHU

Вчені з Інституту інфекційних захворювань у Марселі виявили новий штам коронавірусу. Про це йдеться у дослідженні, опублікованому на медичному порталі MedRxiv.

Найімовірніше, новий штам, що отримав назву B.1.640.2, з'явився у Камеруні. Вперше його виявили у листопаді 2021 року. За інформацією дослідників, новий варіант COVID-19 містить у собі понад 40 мутацій. Даних про його рівень загрози чи заразність поки що немає.

У новому штамі коронавірусу B.1.640.2 виявлено 46 мутацій.

Загалом нетипову комбінацію тести на визначення мутацій коронавірусу показали у 12 жителів міста на південному сході Франції. Наголошується, що отримана інформація свідчить про те, що поява нових штамів коронавірусу передбачити неможливо.

Нові штами інфекції з'являтимуться і надалі. На даний момент COVID-19 демонструє сезонність. Як пояснив професор епідеміології Університету Каліфорнії в Сан-Франциско (США) Джордж Резерфорд, з часом штами коронавірусу набувають все більше мутацій, оскільки вірус прагне стати більш заразним, обходити імунну систему і розмножуватися протягом більш тривалого часу.

Прогнози на майбутнє

За прогнозом біолога, професора Університету Джорджа Мейсона (Вірджинія, США) Анчі Баранової, у 2022 році найімовірніше, встановиться так звана динамічна рівновага, і обидва варіанти вірусу разом «уживатимуться». Вона також припустила, що для посилення захисту існуючими вакцинами, зважаючи на все, треба буде щеплюватися кожні три, а то й кожні два місяці.

При цьому матиме значення частка людей, які мають перехресний імунітет. Це залишковий імунітет, який вже є у деяких людей, хто раніше хворів на один підвид коронавірусу, і тому трошки стійкий до іншого

Професор Університету Аристотеля в Салоніках Демосфен Саріяніс заявив, що штам коронавірусу омікрон, ймовірно, є останньою мутацією COVID-19. На його думку, хвиля заражень може спати вже до 20 лютого. Незважаючи на це, вчений попередив, що серед людей не має «переважати логіку самовдоволення».

Існує думка, що 2022 року пандемія коронавірусу не закінчиться, а весь світ чекають ще як мінімум дві хвилі, пов'язані з омікрон-штамом. Сценарій, за яким омікрон і дельта взаємодіятимуть один з одним у людській популяції, є найважливішим питанням, на яке поки що немає відповіді.

Читайте також: Які фактори спричиняють ускладнення від COVID